Modul EDI biasanya terdiri dari beberapa komponen utama yang bekerja sama untuk menstandarisasi dan mengotomatisasi transmisi data antar perusahaan. Secara garis besar, mereka dapat dibagi menjadi lapisan konversi data, lapisan transmisi komunikasi, lapisan pemetaan bisnis, dan lapisan integrasi sistem, yang masing-masing memiliki tanggung jawabnya sendiri.
Modul konversi dan pemetaan data adalah salah satu komponen inti EDI. Ia bertanggung jawab untuk mengubah data mentah dari sistem internal perusahaan (seperti data ERP atau CRM) menjadi pesan EDI yang sesuai dengan format standar, seperti EDIFACT atau ANSI X12. Pada saat yang sama, perusahaan juga bertanggung jawab untuk melakukan penguraian balik data dari mitra eksternal, mengubahnya menjadi data terstruktur yang dapat dikenali oleh sistem internal perusahaan. Aturan pemetaan lapangan dan aturan validasi data memainkan peran penting dalam proses ini.
Modul komunikasi dan transmisi terutama bertanggung jawab atas transmisi pesan EDI yang aman antar perusahaan yang berbeda. Metode umum mencakup jaringan VAN, protokol AS2, atau metode transmisi berbasis API-. Modul ini biasanya juga mencakup antrian pesan, mekanisme percobaan ulang, dan pemantauan status transmisi untuk memastikan pengiriman data yang andal bahkan di lingkungan jaringan yang kompleks.
Modul integrasi dan manajemen sistem digunakan untuk menanamkan kemampuan EDI ke dalam sistem bisnis perusahaan yang ada. Biasanya terintegrasi secara mendalam dengan ERP, WMS, atau sistem manajemen rantai pasokan untuk mengotomatisasi proses bisnis seperti pemrosesan pesanan, pengiriman, dan rekonsiliasi. Secara bersamaan, modul ini menyediakan fungsi logging, penanganan pengecualian, dan pemantauan, memfasilitasi pelacakan dan pengelolaan proses pertukaran data untuk bisnis.